لا شك ان واحده من المشاكل الشائكه التى طفت على السطح بشكل كبير مؤخرا هي مشكلة الكنائس و المباني التى تقام فيها الصلوات المسيحيه دون ترخيص المشكله تكمن فى أن الحومه طالبت الكنائس الثلاثه الارثوذكسيه و الكاثوليكيه و الأنجيليله بتقديم كشف بالكنائس التي تحتاج إلي توفيق أوضاعها القانونيه من أجل ترخيصها رسميا وفقا لقانون دور العباده الموحد تلك الطلبات التى وصل عددها إلي 3730 طلبا
و لكن الأمر أخذ وقتا طويلا بل و تم أغلاق العديد من تلك الكنائس الغير مرخصه بعد حدوث مناوشات بين متشددين فى أماكن وجود تلك الكنائس أخرها ماحدث في أطفيح و أغلاق كنيسه يتم الصلاه بها منذ 10 سنين كامله
ليقوم الوزير مصطفى مدبولي القائم بأعمال رئاسة مجلس وزراء مصر بدلا من المهندس شريف أسماعيل باصدار تعليمات و توجيهات للحكومه بضرورة الاسراع فى اجراءات تقنين تلك الكنائس الغير مرخصه و تسهيل الأجراؤات فى كافة المحافظات